主審がドロップしたボールは2人以上の競技者に触れることなくゴールに入った場合は得点は認められません。

よって、ドロップされたボールを1人でドリブルしてゴールに入れても得点にはなりません。 

あなたの判断が正しいです。ボールがインプレーになっている時にレフェリーの判断で停止したのですから、その時ボールのあった地点がペナルティーエリア内であればゴールキーパーにボールをドロップして再開します。その時、両チームの他のすべての競技者は、ボールがインプレーになるまで４ｍ以上ボールから離れなければなりません。

警告した後に、ボールのあった地点からドロップボールで再開するのが良かったと考えられます。本ケースは第８条プレーの開始および再開のドロップボールの項目に該当すると考えられます。「主審がプレーを停止し、この条で定められ上記の再開方法が当てはまらない場合、ドロップボールで再開する」とありますように、アウトオブプレーになると判断したが予期に反してボールは風で吹き戻されてインプレーであったが笛を吹いてアウトオブプレーとしてしまったのですから、「上記の再開方法が当てはまらない場合」に該当いたします。

※上記の再開方法とは、キックオフ、（直接または間接）フリーキック、ペナルティーキック、スローイン、ゴールキック、コーナーキックのことです。

笛を吹いた直後に、その誤りに気付いたのですから、それは訂正しなければなりません。この場合は、ドロップボールで再開することになります。

2019/20競技規則の改正で「ボールがペナルティーエリア内にあった。または、ボールに最後に触れられたのがペナルティーエリア内でプレーが停止された場合は、ボールはペナルティーエリア内で守備側チームのゴールキーパーにドロップされる」ことになりました。